El Consejo Rector es el órgano de gobierno y representación de la Unión y está compuesto por Presidente y nueve vocales que representan a los diversos sectores productivos y actividades horizontales.
En la actualidad, los representantes elegidos por la Asamblea General son los siguientes:
Presidente
José Mª Martínez Díaz
Vicepresidente y Vocal Ganadería
Jesús Mª Olías Mariñelarena
Secretario y Vocal Estructuras y Desarrollo Rural
Pedro Jesús Jimeno Vidaurre
Vocal Formación y Medio Ambiente
Jesús Mª Alcalde San Martín
Vocal Vino
Miguel Bujanda Cirauqui
Vocal Aceite
José Fco. Doncel González
Vocal Cultivos Herbáceos
Enrique Echarri San Martín
Vocal Cumas Maquinaria
Enrique Erice Martínez
Vocal Hortofrutícola
Isidro Galarreta Marínez
Vocal Suministros y Nuevas Tecnologías
José Luis Planillo Bastarrica
Interventor de Cuentas
Ángel Mº Rodrigez San Martín
Interventor de Cuentas
Luis Sánchez Marín
Interventor de Cuentas
Gonzalo Visus Calvo